Research Communities

Open Science e COVID-19. Collaborare per contrastare la pandemia

Tuesday, 21 July 2020

L’emergenza sanitaria da Covid-19 ha reso evidente la necessità di collaborare a livello globale. Per trovare soluzioni rapide ed efficaci alla pandemia è doveroso condividere nel modo più aperto possibile dati, pubblicazioni, software e altre tipologie di risultati scientifici. Se ne parlerà in una serie di webinar e tutorial organizzati dai nodi italiani di OpenAIRE, ELIXIR, RDA e EOSC Pillar.

I webinar hanno l'obiettivo di sensibilizzare la comunità scientifica sull’importanza della condivisione dei dati per monitorare l’evoluzione della pandemia Covid-19 e, soprattutto, per la ricerca di una cura efficace. Saranno messe in evidenza disomogeneità e incongruenze nella raccolta dei dati molecolari, epidemiologici e clinici, per poi illustrare strumenti e buone pratiche dell’Open Science e dell’Open Access. 

I tutorial saranno eventi formativi in cui si mostreranno soluzioni specifiche per condividere diversi tipi di dati omici e altri prodotti della ricerca, quali software di analisi e protocolli.

È necessario registrarsi per partecipare e per anticipare eventuali domande ai relatori. Il link per la registrazione si trova di seguito, sotto ciascun incontro.

Webinar: Covid-19 e condivisione del dati: perché in Italia si fa troppo poco?

Martedì 21 Luglio 2020, ore 17:00 (CEST) | 2 ore

Destinatari: Ricercatori, clinici, tecnici, componenti del nodo italiano di RDA, coinvolti nella raccolta, la produzione, l’analisi dei risultati della ricerca di Covid-19 (dati, pubblicazioni, software, ecc…). 

Si tratterà dell'urgenza di aderire a un modello di scienza aperto e collaborativo e degli aspetti specifici dell’Open Science per le ricerche su Covid-19. Inoltre verranno illustrate le principali iniziative europee per la condivisione di dati e risultati di ricerca all'interno della comunità scientifica.

Programma:

• Allegra Via, ricercatrice CNR, coordinatrice della piattaforma di Training di ELIXIR-IT: “Le principali iniziative europee per la condivisione di dati e dei risultati della ricerca a supporto della comunità scientifica. ELIXIR (portale dati Covid-19), OpenAIRE, RDA”.
• Emma Lazzeri, ricercatrice CNR, Coordinatrice OpenAIRE NOAD e nodo italiano RDA: “L'efficacia del modello Open Science e il suo metodo di cooperazione nel contesto della pandemia in corso. Ruolo e azioni di OpenAIRE e RDA”.
• Graziano Pesole, Coordinatore di ELIXIR-IT, Professore UNIBA, associato CNR-IBIOM: “La condivisione dei dati al tempo del Covid-19: sfide e opportunità per l’Italia. Ruolo e azioni di ELIXIR”. 
• Discussione

Link per iscriversi: https://forms.gle/tiiP1oj7ewwMRZBo9 

Webinar: Covid-19 e condivisione dei dati. Il problema dei dati epidemiologici

Previsto per Settembre 2020

Come aggiornare il dato dei nuovi contagi da Covid-19 se le regioni non seguono protocolli uniformi nella somministrazione dei test diagnostici? Siamo di fronte all’assenza di un sistema di monitoraggio univoco tra le regioni. Il webinar vuole essere occasione di confronto e discussione, a partire da alcune delle incongruenze emerse nelle raccolta e gestione dei dati epidemiologici.

Relatori e programma: da definire.

Webinar: Covid-19 e condivisione dei dati. Risorse e strumenti per i dati clinici.

Data da definire

Come sarebbe opportuno procedere per standardizzare la raccolta e la gestione dei dati clinici sull’epidemia da Covid-19, in modo da rendere più efficace il monitoraggio e dunque le politiche sanitarie pubbliche? In questo webinar si mostreranno alcune incongruenze nella raccolta dei dati clinici e si mostreranno i protocolli e le linee guida proposte  dall’Organizzazione mondiale della sanità, dal COVID19 data portal della Commissione europea e le raccomandazioni della Research Data Alliance.

Relatori e programma: da definire.

Tutorial: Covid-19 e condivisione dei dati. Come gestire i dati omici - prima e seconda parte

Date da definire

Due tutorial saranno dedicati ai diversi tipi di dati “omici” rilevanti per lo studio e l’analisi di SARS-CoV-2 (e.g.: virus/host genomics, transcriptomics, proteomics, structural data) e per ciascuno di essi saranno mostrati:

• i vantaggi della condivisione dei dati
• raccomandazioni/linee-guida/procedure per il processamento e la condivisione dei dati in archivi pubblici
• come rendere i dati FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable)
• sfide e aspetti da tenere in considerazione

Relatori e programma: da definire.

Tutorial: Covid-19 e condivisione del software. Protocolli e altri strumenti per l’analisi di dati.

Data da definire

La ricerca scientifica è spesso possibile grazie ai vari software di analisi dei dati. Questi, tuttavia, non sempre sono sviluppati, manutenuti e condivisi in modo da assicurare qualità e riproducibilità. In questo tutorial saranno esposti in modo pratico e concreto best practices e linee guida per applicare i principi dell’Open Science ai vari strumenti per l’analisi dei dati. 

Relatori e programma: da definire.

 

Comitato Organizzatore:

Francesca De Leo CNR-IBIOM

Emma Lazzeri CNR-ISTI

Loredana Le Pera CNR-IBIOM (e CNR-IBPM)

Gina Pavone CNR-ISTI

Allegra Via CNR-IBPM

Citizen Science OpenAIRE activities in Education

Tuesday, 30 June 2020

This webinar starts with a short introduction to OpenAIRE, followed by a description of OpenAIRE Citizen Science Initiatives and activities. More specific, the presentation focuses on the:

School Seismograph Network

• Presentation of the School Seismograph Network
• Implementation of the OpenAIRE approach to enable the school’s seismograph data collections (OpenAIRE PROVIDE, Zenodo), exploration (OpenAIRE EXPLORE) and applications (HELIX, HACKQUAKE). How OpenAIRE products embrace the active participation of schools into the Open Science ecosystem

Open Schools Journal for Open Science (OSJ)

• STEM focused Open Schools Journal for Open Science, supported by OpenAIRE and how it enables students and teachers to learn about the Open Science ecosystem, rules and guidelines (i.e. licensing, metadata). Also, how teachers and students can find in Zenodo the Journal’s articles and datasets by participating in Zenodo communities in order to include them in their daily routines
• Best practices by students’ involvement in the OpenAIRE Citizen Science Initiatives

Bringing Nobel Prize Physics to the Classroom with Zenodo

• Presentation of a series of educational activities aiming to introduce Nobel Prize Physics to the Classroom are being developed and documented in Zenodo.

How you can participate and how to follow training actions

Q&A session

Highlight: New students discovery in the Open Schools Journal for Open Science: "Since 2009, Kepler Space Telescope has been recording small reductions (eclipses) in the light of distant stars due to the transit of planets in front of them. Our goal is to detect planets in orbit around distant stars from Kepler's mission data, following the Reading Method using two programs written by our team in programme language C. If the readings are detected and confirmed, we proceed to their analysis. characteristics of the planet: Ray, inclination, distance from the star, and especially if it is in the so-called "habitable zone" which will make it possible to maintain life. However, we have already identified such an exoplanet in orbit around the star KIC 1432789, the characteristics of which our team analyzed for the first time." - from

Κυνήγι Εξωπλανητών

Transformative agreements in Italy

Friday, 26 June 2020

La crisi COVID ha reso ancor più evidente la necessità dell'accesso immediato alla ricerca scientifica.

Sulla spinta delle istanze Open Science e Open Access, anche il mondo della contrattazione per le risorse elettroniche sta cambiando.

I "transformative agreements" sembrano essere lo strumento con il quale gestire in modo efficace la transizione all'accesso aperto e immediato.

Ma cosa sono di preciso i contratti trasformativi? E come si sta muovendo l'Italia?

OpenAIRE organizza un webinar per fare il punto sulla situazione, il 26 giugno, alle 11.

Ne discuteremo con 

- Colleen Campbell, OA2020: Cosa sono i contratti trasformativi e il loro contesto internazionale (30 minuti)

- Nino Grizzuti, coordinatore CARE CRUI: La stagione degli accordi trasformativi. Il contributo CRUI-CARE (15 minuti)

I restanti 15 minuti saranno dedicati alle domande.

Per motivi organizzativi è necessario registrarsi. Il form consente ai partecipanti di anticipare eventuali domande ai relatori.

IL LINK PER PARTECIPARE VERRÀ COMUNICATO VIA EMAIL AGLI ISCRITTI UN’ORA PRIMA DELL’INIZIO

RGPD y aspectos legales relacionados con la gestión de datos de investigación

Tuesday, 23 June 2020

La Fundación Española para la Ciencia y Tecnología (FECYT), como NOAD para España del proyecto OpenAIRE, organiza este seminario web sobre RGPD y aspectos legales en la gestión de datos de investigación. 

En este webinar se proporcionará una perspectiva legal sobre la gestión de datos de investigación, tanto teórica como práctica: ¿Cómo se manejan los datos personales sensibles en investigación? ¿Cuáles son los posibles problemas de privacidad cuando se utilizan datos personales en una investigación? ¿Qué se necesita saber sobre la RGPD y la nueva directiva PSI?

El contenido del seminario será relevante para investigadores, bibliotecarios y administradores de investigación de todos los campos (incluidas las ciencias sociales y las humanidades). Habrá también tiempo para preguntas y respuestas durante la sesión, además de poder enviar preguntas a través de este formulario.

Una vez realizada la inscripción, recibirá el enlace del seminario web en el correo electrónico recordatorio enviado.

Amnesia

Wednesday, 10 June 2020

Speaker: Manolis Terrovitis (Athena Research Centre)
Date: June 10th 2020
Time: 2 PM CEST


Amnesia is a flexible data anonymization tool that transforms relational and transactional databases to dataset where formal privacy guaranties hold. Amnesia transforms original data to provide k-anonymity and km-anonymity: the original data are transformed by generalizing (i.e., replacing one value with a more abstract one) or suppressing values to achieve the statistical properties required by the anonymization guaranties. Amnesia employs visualization tools and supportive mechanisms to allow non expert users to anonymize relational and object-relational data. 

Amnesia is implemented in java and javascript and it can be used as a standalone application or as a service. Moreover, it provides a ReST service API to allow the incorporation of its anonymization engine to other information systems. The tool is available through OpenAIRE and it has been used in several research projects including MEDA and MyHealthMyData.

 

Dr. Manolis Terrovitis  is a Researcher at the Information Management Systems Institute (IMSI) of Research Center Athena. His research work includes big data analytics, data privacy and anonymization methods. He received his PhD from the National Technical University of Athens (2007) and has been with the Department of Computer Science of The University of Hong Kong as a post-doctoral researcher (2007-2008). In 2009 he joined IMSI, first as a post-doctoral researcher and then as a Researcher. Google Scholar reports over 1900 citations to his work, which includes publications to some of the most prestigious venues in data management (VLDB, VLDBJ, TKDE etc). He has served as president of the Hellenic Accreditation System and a member of the Board of Directors of Information Society S.A. He head of Amnesia development in Athena RC and he has been involved in several national and EU funded R&D projects.  He has worked as a consultant at the private and public sector on the design and performance optimization of information systems and he is working as a Data Protection Officer in the National Network for Precision Medicine in Cardiology and in Oncology. Moreover, he has extensive experience on the application of privacy-by-design principles in the information ecosystems.

Plan S: Taking stock of the current situation and new developments

Wednesday, 27 May 2020

This OpenAIRE Policy and Legal Task Force webinar focuses on recent developments around Plan S. Johan Rooryck, cOAlition S Open Access Champion, talks about cOAlition S and what Research funding organizations in cOAlition S want; research visibility; Plan S: strong principles; implementation guidance: key challenges, routes to compliance, transformative arrangements; implementation: developing a Journal Checker Tool; working with key stakeholders: researchers, early career researchers, publishers, universities; and other activities: transparent pricing and Fair Open Access Alliance (FOAA), non-APC funding models and cOAlition S office. Niamh Brennan, Trinity College Dublin and OpenAIRE NOAD in Ireland, talks about Ireland’s experience with its National Open Science Strategy and Plan S: the scholarly publishing landscape in Ireland, Ireland’s Open Access Repository Network and National Open Access Research Portal http://rian.ie, HRB Open Research, National Open Research Forum, mapping national OA Policy to Plan S (1st iteration), National Framework on the Transition to an Open Research Environment – ‘Plan S-friendly’ – but its primary concern is to be more ‘Irish research-friendly, ‘AmeliCA-friendly’ – in terms of its emphasis on academy-based infrastructures and on  alternatives to fee-based publishing and supportive of scholarly communication initiatives in the Global South, stressing equity, bibliodiversity and revisiting the issues of copyright and licences, immediate Open Access & Choice of Open Access Route calling to end publisher embargoes on researchers self-archiving their AAMs, and diamond publishing. The webinar recording also includes questions and discussion.

Accesso aperto nelle scienze della Terra e dell’ambiente

Thursday, 14 May 2020

Organizzato da IGG e ISTI attraverso il National Open Access Desk di OpenAIRE, il seminario intende guardare al mondo dell’Open Science dal punto di vista specifico delle scienze della Terra e dell’ambiente.

Quali sono le ragioni alla base delle politiche europee sull’Open Science e come si declinano nello specifico delle scienze della Terra? Nel seminario in programma per il 14 maggio si parlerà delle motivazioni che spingono ad adottare pratiche per rendere la scienza più aperta e trasparente, con un taglio disciplinare specifico, quello appunto delle discipline della Terra e dell’ambiente. 

Il seminario Open Science: come dare accesso aperto alla conoscenza, Un focus sulle scienze della Terra e dell’ambiente affronterà gli aspetti di base e fornirà alcuni strumenti pratici, tra cui:

• le motivazioni alla base dell’Open Science
• l’Open Access alla letteratura scientifica
• la gestione dei dati della ricerca (aspetti legali, dati FAIR e dati open)
• l’Open Science e le infrastrutture europee per le scienze della Terra e dell’ambiente.

Saranno fornite indicazioni su strumenti e buone pratiche utili a inserire la scienza aperta nel ciclo quotidiano della ricerca, mostrandone i vantaggi e le implicazioni etiche. Una parte del seminario sarà dedicata agli obblighi previsti dai finanziamenti della Commissione Europea in H2020 e nel prossimo programma quadro Horizon Europe. Inoltre si getterà uno sguardo ai  passi compiuti in questi anni dalla Commissione Europea a favore della Open Science, anche attraverso la costituzione di Infrastrutture di ricerca dedicata alle scienze della Terra e dell’ambiente.

Il seminario durerà 1 ora e 30 minuti, seguiti da altri 30 minuti per le domande e la discussione.

Il seminario è pensato per ricercatori afferenti al dipartimento di scienze della Terra e dell’ambiente del CNR e in generale per tutto il personale di ricerca che lavora su progetti finanziati dalla Commissione Europea.

Docenti: Emma Lazzeri (CNR-ISTI, Pisa), Mariasilvia Giamberini (CNR-IGG) e Gina Pavone (CNR-ISTI, Pisa)

Appuntamento al 14 maggio, dalle 11:00 alle 13:00.

Compilando questo form potrete registrarvi e ottenere il link per assistere al webinar 

La registrazione del webinar, le slide e tutto il materiale di supporto saranno resi accessibili attraverso questa pagina.

Cooperative Non-APC Publishing Models

Monday, 11 May 2020

Discussion about non-APC strategies, challenges and recommendations and a global collective action. Arianna Becerril-García (Executive Director, Redalyc, Professor, UAEM, Chair, AmeliCA) talks about AmeliCA - a multi-institutional community-driven initiative supported by UNESCO and led by Redalyc and CLACSO aimed to provide a cooperative, sustainable, protected and non-comercial infrastructure for Open Knowledge. Tanja Niemann (Executive Director, Érudit) and Jason Friedman (Manager, Member and Metadata Services, Canadian Research Knowledge Network) talk about Coalition Publica and the Partnership for Open Access: Canada's Cooperative Non APC Publishing Model. Jean-Claude Guédon discusses the current landscape, challenges, collaborations, "inside-out" libraries (Lorcan Dempsey's vocabulary), and provides recommendations about fostering a richer bibliodiversity and ensuring publication and access equality for all. And Iryna Kuchma (EIFL Open Access Programme Manager, OpenAIRE) presents the OpenAIRE report Towards Sustainable Cooperative and Non-APC Publishing Model. 

Open Research Gateway for the ELIXIR-GR Infrastructure

Wednesday, 06 May 2020

 

Athena Research Center and the Institute of Applied Biosciences of the Center for Research and Technology Hellas, in the context of collaborative activities undertaken between the OpenAIRE Greek NOAD and ELIXIR-GR, also supported by the RDA Ambassador programme, join forces to inform their communities about new services available for research and tailored support provided through their networks.

We invite you to take part in this collaborative webinar:

“Open Research Gateway for the ELIXIR-GR Infrastructure”

When? Wednesday, May 6 2020

Time? 11.00 - 13.00 EEST

Language: English

Target Audience: Researchers, Early Career Researchers, Health Sciences Librarians

The webinar will consist of a set of presentations, a demo and a virtual break out session. It will start with setting the scene by communicating work performed in OpenAIRE, RDA and ELIXIR-GR, both separately and collectively. It will then proceed to demonstrate the OpenAIRE Research Community Dashboard and provide hands-on exercises for participants to follow in groups. 

The demo and the hands-on session will be about OpenAIRE services for Open Science offered to research communities and research infrastructures, with a focus on services for research performed in the ELIXIR-GR network. Moreover, participants will explore the possibilities of the Open Research Gateway for ELIXIR-GR (https://beta.elixir-gr.openaire.eu/), developed in order to collect in one single entry point all research artefacts produced by various services and tools of the ELIXIR infrastructure. They will also have the opportunity to use the gateway, provide their feedback, suggest new functionalities and features, and discuss how Open Science practices can be promoted, implemented and monitored in their research field.

Agenda has as follows:

- General introduction, welcome, etc (Thanasis Vergoulis, ATHENA RC / ELIXIR-GR ~5')
- Introduction to RDA (Fotis Psomopoulos, INAB|CERTH / RDA Ambassador on Bioinformatics ~5’)
- Introduction to OpenAIRE and the Greek node (Elli Papadopoulou, ATHENA RC / OpenAIRE Greek NOADs coordinator~15')
- Open Research Gateway for ELIXIR-GR Infrastructure (Alessia Bardi, CNR / OpenAIRE RCD product manager ~30-45')
- Q&A (15'-30')
- Breakout sessions for practical use of the ELIXIR-GR Open Research Gateway (supported by OpenAIRE technical team colleagues: Pedro Príncipe and André Viera from UMinho, Miriam Baglioni from CNR ~30')

GDPR and Research: Where We Stand

Monday, 04 May 2020

 

 

The National Open Access Desks in Greece and Cyprus, continue their webinar series to inform about key Open Science issues in support of their scientific and academic communities’ needs. This month, the focus is on the General Data Protection Regulation - GDPR and its application to the research process.

OpenAIRE Webinar: “GDPR and Research: Where We Stand”

When: May 4, 2020

Time: 11:00 a.m. - 12:00 p.m. EEST

Language of Presentation: Greek

Target Audience: Librarians, Academics, Researchers, Students

We are pleased to announce that the guest speaker of this webinar is legal expert Prodromos Tsiavos, Legal Adviser of "Athena" Research & Innovation Center and OpenAIRE.

The GDPR complexity resulted in the need to better understand the regulation’s provisions and how it is applied in the research conduct, also in line with Open Science. The purpose of the webinar is to analyze important issues surrounding the application of the Regulation at all stages of the research lifecycle. More specifically, the webinar will examine the following:

• The basic concepts of GDPR
• The exception for scientific research
• Special categories of personal data
• Management of personal data within the research cycle
• Digital services for Open Science and GDPR

OpenAIRE Legal Policy Webinars

Wednesday, 29 April 2020
Monday, 04 May 2020

OpenAIRE is happy to announce two public webinars in our Legal Policy Webinar series: one on Wednesday April 29th, and the other on Monday May 4th, at 2 PM CEST. 

How do you deal with sensitive personal data in biomedical research? What are potential privacy issues when using personal data for your research? What do you need to know about the GDPR and the new PSI directive?  

In these webinars, our experts Prodromos Tsiavos (Senior Legal Advisor - ARC/ Head of Digital and Innovation - Onassis Group), Thomas Margoni (CREATE Glasgow) and Jacques Flores Dourojeanni (Research Data Management Consultant Utrecht University Library) will provide a legal perspective on research data management - both theoretical and practical. Given the current health crisis, the practical examples will focus on biomedical sciences and medical data - but the webinars will be relevant for researchers and research admin from all fields (including social sciences and humanities). 

We invite researchers and research support staff to join these webinars. The webinar on April 29th will have a researcher-centered approach, while the webinar on May 4th will focus on research support and advice services. Of course , you are welcome to attend both webinars, but take into account that there might be some overlap. 

Both webinars will allow for generous Q&A time, and you have the possibility to submit your questions at registration. 

You will receive the webinar link upon registration and in the reminder email sent in the morning of the webinar. 

29th April 2 PM CEST: Webinar aimed at PhD students/ researchers : recommendations for researchers on reusing data -  legal aspects: what you need to know about GDPR (General Data Protection Regulation) and PSI (Public Sector Information) Directive - common misperceptions and troubleshooting -  practical examples. 

4th May 2 PM CEST: Webinar aimed at research support staff: what are relevant things to know when it comes to GDPR, new PSI directive and IPR - how to advise researchers - common misperceptions and troubleshooting - practical examples.

 

• When: April 29th and May 4th at 2 PM CEST

Open Access, come e perché

Tuesday, 18 February 2020

A seguito del successo del webinar Open Access, come e perché del 6 febbraio scorso, che ha superato il limite massimo di 500 iscritti, riproponiamo gli stessi contenuti per chi non fosse riuscito a seguirlo.

Volete conoscere l'ABC dell'Open Access per districarvi con il Bando VQR 2015-2019, che prevede all'articolo 8 l'Open Access per i prodotti sottoposti a valutazione?
OpenAIRE organizza un webinar introduttivo su Cos'è e come si fa Open Access.
Scopo del webinar non è ancora di dare indicazioni operative sulla VQR ma solo di chiarire le logiche e le modalità dell'Open Access e fornire strumenti utili per esempio alla verifica delle politiche di copyright degli editori. Dalle politiche di copyright infatti dipende la versione che sarà possibile depositare per la VQR.
Il webinar avrà la durata di 30 minuti (+30 minuti di domande).

Il webinar è pensato per ricercatori, docenti, studenti di dottorato e in generale per tutto il personale di ricerca che lavora su progetti finanziati dalla Commissione Europea, il Ministero dell'Università e della Ricerca, e che viene sottoposto a valutazione.

Docenti: Elena Giglia (Università di Torino) ed Emma Lazzeri (CNR-ISTI Pisa)
Appuntamento al 18 febbraio, dalle 15:00 alle 16:00, all'indirizzo https://zoom.us/j/324191427
Gradita la registrazione su https://forms.gle/Qyo2rPnBv66SMum76 anche per eventuali contatti/approfondimenti futuri.

Elena Giglia
Emma Lazzeri
Gina Pavone

Open Access, come e perché

Thursday, 06 February 2020

Webinar on the OpenAIRE Research Graph

Thursday, 30 January 2020

OpenAIRE is pleased to announce the beta release of its Research Graph, a massive collection of metadata and links between scientific products such as articles, datasets, software, and other research products, entities like organisations, funders, funding streams, projects, communities, and data sources. Due to its coverage and cross-discipline nature, the Research Graph will empower the EOSC catalogue of scientific products.

On January 30th, 2020, OpenAIRE is organizing its final webinar in the first consultation series.

 

UPDATE: there will be a follow-up consultation in Spring 2020, stay tuned!

Open Science and Research Results Exploitation: friends or foes?

Friday, 29 November 2019

This OpenAIRE and EOSC-hub webinar covers Horizon 2020 rules and good practices approaches to addressing Open Data, Open Science and research results exploitation in Consortium Agreements and in Data Management Plans. It also specifically covers the issues of concern between Open Science and exploitation (patents, spin offs/ outs, confidentiality), business planning and licensing strategies.

Date: Friday, 29 November at 2:00pm CET

 

This webinar is organised in collaboration with EOSC-Hub